Nous comprenons et contribuons aux démarches scientifiques

Découvrez les Services d'ADLIN

Démultipliez vos capacités bioinformatiques avec l’expertise ADLIN

Nos bioinformaticiens s’intègrent comme un véritable appui à vos équipes de biologie, en parlant leur langage et en comprenant leurs enjeux.
Ils transforment vos besoins scientifiques en analyses reproductibles et exploitables, pour accélérer la conduite de vos projets.

DNA

Epigenetics

Technology:
- ChIP-seq
- Bulk & single-cell ATAC-seq
- Methylation array
- Cut&Tag Seq

Analysis:
- Integration with gene expression
- Binding proteins & histone modifications
- Chromatin accessibility

RNA

Single-cell RNAseq

Technology:
- Single-cell RNA-seq
- Single Cell Immune Profiling (VDJ analysis)
- Spatial transcriptomics (Xenium & Visium)
Analysis:
- Quality control
- Exploratory gene expression analysis
- Clustering & Cell annotation
- Trajectory inference
- Cell-cell communication
- Regulatory network

DNA

Genomics & Metagenomics

Technology:
- WGS
- WES
- Targeted-sequencing
- Metabarcoding
- Shotgun
Analysis:
- Assembly & gene prediction
- Structural and functional annotation
- Genome characterization
- Comparative genome analysis
- Genome analysis of the microbiome
- Functional analysis
- Phylogenetic analysis

Schéma circulaire représentant les 4 typologies ouvertes par les services ADLIN en bioinformatique

RNA

Transcriptomics & Translation

Technology:
- Short-reads Illumina RNA-seq
- Long-reads RNA-seq (Nanopore or PacBio)
- Microarray
- Ribosome Profiling & RiboSeq & PolySeq
- RiboMethSeq
Analysis:
- Differential expression analysis & Molecular pathway enrichment
- De novo transcriptome assembly
- Alternative splicing analysis
- Translation efficiency
- ORF identification / analysis
- Post-transcriptional modifications

Metabolite

Metabolomics

Technology:
- LC-MC
- GC-MS
Analysis:
- Global profiling
- Untargeted & Targeted metabolomics
- Lipidomics

Protein

Proteomics

Technology:
- LC-MS/MS
‍Analysis:
- Protein identification
- Protein quantification & differential expression
- Post-translational modifications
- Protein-protein interaction networks

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Structurez, exploitez, valorisez vos données avec ADLIN

Nos équipes vous accompagnent dans la structuration et l’exploitation de vos données.
Transformez vos jeux de données hétérogènes en ressources exploitables, prêtes à soutenir vos projets scientifiques.

Structuration

Modélisation & Standardisation des données

Définir et optimiser votre flux de données en fonction de vos processus scientifiques
Création et mise en place d’un modèle de données spécifique

‍

Structuration

Préparation des données

Omics, Clinique, Imagerie, RWE
Garantir la cohérence et la fiabilité des données
Améliorer la qualité des données
Standardiser et structurer les informations
Extraire les données pertinentes pour répondre à votre problématique scientifique
Utilisation d’outils NLP
Utilisation d’outils propriétaires de contrôle qualité des données
Trier et filtrer
Agrégation et fusion des données

Exploration

Statistiques descriptives & Analyse exploratoire

Distribution
Tendance (moyenne, médiane, mode)
Variabilité (étendue, écart-type, variance)
Inférence statistique
Réduction de dimension
Corrélation
Séries temporelles

IA

Deep Learning

Graph neural networks
Feed-forward
Recurrent network
Convolution layers

Schéma circulaire représentant les 4 typologies ouvertes par les services ADLIN en Data et data management

Exploration

Mise en place de tableaux de bord
Utilisation de vos outils propriétaires
Déploiement des outils propriétaires d’ADLIN
Intégration et utilisation d’outils open source

IA

Machine Learning classique

Random Forest
Support Vector Machine

Intégration

Datasets multimodaux

Multi-omique
Pharmacogénomique
Pharmacocinétique
Réseaux

Exploration

Visualisation

Comparaisons
Proportions
Relations et hiérarchies
Distributions
Plages, parties d’un ensemble
Flux, évolution dans le temps, tendances

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